上述本站小編說的是稅務機關對于異常憑證的處理辦法，接下來本站小編告訴大家作為納稅人自己要怎么保護自己的合法權益，總的來說有兩種方式，。發生下列第2種情形，導致稅務機關無法實施約談的，在納稅人主動聯系主管稅務機關之前，主管稅務機關可通過增值稅發票系統升級版暫停該納稅人開具發票，并將其取得和開具的增值稅發票列入異常憑證范圍，錄入增值稅抵扣憑證審核檢查系統。因下列第三種情形，導致無法約談的，主管稅務機關可通過升級版暫停該納稅人開具發票，同時暫停其網上申報業務，將其近60天內取得和開具的增值稅發票列入異常發票范圍，并應在2個工作日內，錄入增值稅抵扣憑證審核檢查系統，開展異常發票委托核查。

　　在公司的經營過程中，憑證是比較常見的，一般的憑證是可以進行抵扣的，但是有時候企業會收到一些異常憑證，遇到這種情況的話要怎么處理呢？不知道的話，讓本站小編來告訴你吧！

　　增值稅一般納稅人取得的異常增值稅扣稅憑證按不同情形區分處理：

　　1、增值稅一般納稅人取得異常憑證，尚未申報抵扣或申報出口退稅的，暫不允許抵扣或辦理退稅；

　　2、已經申報抵扣的，一律先作進項稅額轉出；

　　3、已經辦理出口退稅的，稅務機關可按照異常憑證所涉及的退稅額對該企業其他已審核通過的應退稅款暫緩辦理出口退稅，無其他應退稅款或應退稅款小于涉及退稅額的，可由出口企業提供差額部分的擔保。

　　4、經核實，符合現行增值稅進項稅額抵扣或出口退稅相關規定的，企業可繼續申報抵扣，或解除擔保并繼續辦理出口退稅。

　　上述本站小編說的是稅務機關對于異常憑證的處理辦法，接下來本站小編告訴大家作為納稅人自己要怎么保護自己的合法權益，總的來說有兩種方式：

　　1、妥善溝通主管稅務機關

　　對于存在真實交易行為的一般納稅人，可以提供相關證據向主管稅務局提出自身合法訴求，充分爭取適用稅務總局有關善意取得增值稅專用發票的規定，從而不繳納滯納金，相關發票不再進行企業所得稅調增。

　　如果主管稅務機關堅持進項稅額轉出并加收滯納金，企業可以考慮是否提起稅務行政復議以及后續的行政訴訟，畢竟主管稅務機關僅憑相關名單就做出行政處理處罰，在證據采集上是存在瑕疵的，那么企業就有希望通過司法途徑繼續維護自身權益。

　　2、及時起訴對方公司

　　一般而言，收款方開具發票是交易合同的附屬義務，即便交易合同未明確規定，購買方也有權要求對方開具合法有效的發票。受害企業通過提起訴訟，在合同、銀行付款憑證等證據支持下，法院一般會要求被告完整履行合同義務。如果對方拒不履行法院生效文書，受害企業可以申請強制執行，將對方企業列入失信名單，通過限制其法定代表人進行高消費來實現實現警示作用。如果對方企業屬于認繳出資，而且企業拒絕履行相關生效判決，受害企業甚至可以要求其股東賠償其經濟損失，當然要以認繳出資為限。

　　看了一般納稅人取得異常憑證的處理辦法之后，我們再來看一下哪些發票會被列入異常憑證管理范圍之內，在平常的使用過程中注意預防。

　　1、走逃（失聯）企業的異常憑證

　　稅務機關依照規定的程序和方法、履行規定的手續后，依法判定為走逃（失聯）的企業，發生下列情形之一的，所對應屬期開具的增值稅專用發票列入異常憑證范圍。

　　（1）商貿企業購進、銷售貨物名稱嚴重背離的；生產企業無實際生產加工能力且無委托加工，或生產能耗與銷售情況嚴重不符，或購進貨物并不能直接生產其銷售的貨物且無委托加工的。

　　（2）直接走逃失蹤不納稅申報，或雖然申報但通過填列增值稅納稅申報表相關欄次，規避稅務機關審核比對，進行虛假申報的。

　　2、稅收風險分析評估中發現的異常憑證

　　發生下列第2種情形，導致稅務機關無法實施約談的，在納稅人主動聯系主管稅務機關之前，主管稅務機關可通過增值稅發票系統升級版暫停該納稅人開具發票，并將其取得和開具的增值稅發票列入異常憑證范圍，錄入增值稅抵扣憑證審核檢查系統。

　　（1）增值稅一般納稅人存在購進、銷售貨物（服務）品名明顯背離，虛假填列納稅申報表特定項目以規避稅務機關審核比對等。

　　（2）電話、地址等稅務登記信息虛假無法聯系或兩次約談不到。

　　3、發票開具和納稅申報數據監控發現的異常憑證

　　稅務機關在對納稅人開票數據進行實時監控分析預警中發現下列第一種情形的，或者對增值稅納稅申報數據的監控中發現下列第二種情形的，作為異常情形，應及時約談納稅人。因下列第三種情形，導致無法約談的，主管稅務機關可通過升級版暫停該納稅人開具發票，同時暫停其網上申報業務，將其近60天內（自納稅人最后一次開票日期算起）取得和開具的增值稅發票列入異常發票范圍，并應在2個工作日內，錄入增值稅抵扣憑證審核檢查系統，開展異常發票委托核查。

　　（1）納稅人存在購銷不匹配、有銷項無進項、大部分發票頂額開具、發票開具后大量作廢、發票開具金額突增等異常情形。

　　（2）納稅人當期申報存在未開具發票（或開具其他發票）欄次填報負數；無免稅備案但有免稅銷售額；應納稅額減征額填報金額較大；進項稅額轉出填報負數；當期農產品抵扣進項占總進項比例較大且與實際經營情況不符；代扣代繳稅收繳款憑證、運輸費用結算單據等欄填報數額異常等情形。

　　（3）地址、電話等稅務登記信息虛假無法聯系或者經稅務機關兩次約談不到的。

　　4、非正常戶的失控發票

　　已辦理稅務登記的納稅人發生未按照規定的期限申報納稅情形的，在稅務機關責令其限期改正后，逾期仍然不改正的，稅務機關應當派員實施實地檢查程序。對于履行核查手續后，查無下落并且無法強制其履行納稅義務的，由檢查人員制作非正常戶認定書，存入納稅人檔案，認定其為非正常戶。對于非正常戶所持有的增值稅發票，稅務機關按照失控發票采集標準，將相關增值稅專用發票列入防偽稅控系統，實施失控發票管理。

　　5、稽核比對結果的異常抵扣憑證

　　在增值稅稽核比對中，通過全國增值稅專用發票稽核系統產生稽核比對結果為“不符”、“缺聯”、“屬于作廢”的增值稅專用發票，列入異常抵扣憑證管理。對于這些異常憑證的判斷和處理需要結合不同的情況。

　　本站小編在這里要提醒大家在平常的稅務問題處理上一定要小型謹慎，避免收到異常憑證的發票，也不要被稅務機關列入異常憑證管理之列，如果還有問題的話，可以找本站小編，小編幫你解決。